בשנת 2000 קם ארגון השחקן ה-12 ועם הזמן הוכן לארגון סמלו הראשון הסמל שכיכב באותם ימים היה נמר שפרץ מתוך כדור אל אוויר העולם ולמעשה שימש סמל הארגון כשנתיים וחצי.
בשנת 2002 (תחילת עונת 02/03) נוצרו לארגון שני סמלים קבועים. שני סמלי ארגון השחקן ה-12 מספרים ומשקפים למעשה את הסיפור שעומד מאחורי המועדון והסמל של מכבי תל אביב.
החייל היהודי
החייל היהודי שבסמל השחקן ה-12 הוא בעצם יהודה המכבי, מהחג היהודי "חנוכה", שעל סמך סיפור חג זה קם ארגון הספורט "מכבי".
חייל היהודי שבסמל הארגון מחזיק בידו השמאלית מגן, שעליו מוטבע המגן דוד של ארגון השחקן ה-12, ובידו הימנית מחזיק כידון שעליו קשור סרט שבו רשומות ראשי התיבות של מכבי – "מי כמוך באלים ה' ".
המגן דוד
אם סמלו הראשון של הארגון התייחס לזהות היהודית של מכבי תל אביב, אזי שהסמל השני מתייחס לזהות השניה של הקבוצה – הציונות.
מכבי תל אביב הוא ארגון ספורט יהודי ציוני, שקם בין היתר במטרה להפיץ את הרעיון הלאומי בעם, וכתוצאה מכך סמל הקבוצה הוא המגן דוד.
אנו בארגון השחקן ה-12, בחרנו באופן טבעי, שכך יהיה גם סמלנו, בתוספת של הספרה 12 עגן דוד.